杭州城市學研究理事會成立于2009 年，是杭州城市學、杭州學研究的領導機構，負責研究工作的統一規劃、統一組織、統一協調和統一執行。原中共浙江省委常委、杭州市委書記，杭州城市學研究理事會理事長，浙江省首批新型重點專業智庫浙江省城市治理研究中心主任、首席專家，浙江大學兼職教授、兼職博士生導師，中央美術學院客座教授、客座博士生導師，浙江省大運河文化保護傳承利用暨國家文化公園建設工作專家咨詢委員會主任王國平擔任理事會理事長，杭州市有關領導、高校領導、知名專家學者擔任副理事長，邀請城市領域專家學者、城市管理者、城市學戰略合作單位負責人擔任理事。理事會每年舉行全體會議或理事會議，研究部署城市學研究工作的重大事項。理事會秘書處設在杭州城研中心，負責相關溝通聯絡和日常工作。