為更好地開展城市學、杭州學研究工作，為城市學、杭州學研究工作提供有力保障，杭州城市學研究會于2013 年成立了杭州城市學研究會專項基金委員會，設立城市學研究專項基金。杭州城市學研究會專項基金主要用于開展城市學和杭州學相關的學術研究工作，扶持城市學、杭州學研究人才的培養，以及支持城市學、杭州學科研設施的投入，努力探索具有中國特色、杭州特點的城市科學發展之路。目前，基金會成員單位有阿里巴巴集團、杭州商旅集團、杭汽輪集團、杭州銀行、西子聯合集團、富通集團、華立集團、浙江中煙公司等。